HÓA ĐƠN ĐẦU VÀO BỊ BỎ SÓT – KÊ KHAI VÀ XỬ LÝ THẾ NÀO?

Công văn 2703/VLO-QLDN3 hướng dẫn xử lý hóa đơn GTGT bị bỏ sót theo từng trường hợp như thế nào?

Bên cạnh quy định tại Luật Thuế GTGT 2024 và Nghị định 181/2025/NĐ-CP, Công văn 2703/VLO-QLDN3 cũng hướng dẫn cụ thể cách kê khai hóa đơn GTGT trong một số tình huống phát sinh trên thực tế như sau:

Như vậy, việc xử lý hóa đơn GTGT bị bỏ sót không chỉ phụ thuộc vào thời điểm phát hiện sai sót mà còn phụ thuộc vào mức độ ảnh hưởng của sai sót đến số thuế phải nộp, số thuế được khấu trừ hoặc điều kiện thanh toán của hóa đơn. Doanh nghiệp cần xác định đúng từng trường hợp để lựa chọn phương án kê khai phù hợp, tránh phát sinh sai sót hoặc bị xử phạt về thuế.

Hóa đơn đầu vào bị bỏ sót kê khai vào kỳ nào? Cách xử lý từng trường hợp

Việc kê khai hóa đơn đầu vào bị bỏ sót được thực hiện tùy thuộc vào tác động của sai sót đến số thuế GTGT phải nộp, số thuế được hoàn hoặc số thuế GTGT còn được khấu trừ chuyển kỳ sau.

Căn cứ điểm đ khoản 1 Điều 14 Luật Thuế giá trị gia tăng 2024 quy định về khấu trừ thuế GTGT đầu vào như sau:

“đ) Thuế giá trị gia tăng đầu vào phát sinh trong tháng, quý nào được kê khai, khấu trừ khi xác định số thuế phải nộp của tháng, quý đó. Số thuế giá trị gia tăng đầu vào chưa được khấu trừ hết trong tháng, quý thì được khấu trừ vào tháng, quý tiếp theo.

Trường hợp cơ sở kinh doanh phát hiện số thuế giá trị gia tăng đầu vào khi kê khai, khấu trừ bị sai, sót thì được khai thuế trước khi cơ quan thuế, cơ quan có thẩm quyền công bố quyết định kiểm tra thuế, thanh tra thuế như sau:

Người nộp thuế thực hiện khai bổ sung vào tháng, quý phát sinh số thuế giá trị gia tăng đầu vào bị sai, sót nếu việc khai thuế vào tháng, quý phát sinh số thuế giá trị gia tăng đầu vào bị sai, sót làm tăng số thuế phải nộp hoặc giảm số thuế được hoàn; người nộp thuế phải nộp đủ số tiền thuế phải nộp tăng thêm hoặc bị thu hồi số tiền thuế đã được hoàn tương ứng và nộp tiền chậm nộp vào ngân sách nhà nước (nếu có).

Người nộp thuế thực hiện khai vào tháng, quý phát hiện sai, sót nếu việc khai thuế vào tháng, quý phát sinh số thuế giá trị gia tăng đầu vào bị sai, sót làm giảm số tiền thuế phải nộp hoặc chỉ làm tăng hoặc giảm số thuế giá trị gia tăng còn được khấu trừ chuyển sang tháng, quý sau.”

Đồng thời, căn cứ khoản 6 Điều 23 Nghị định 181/2025/NĐ-CP, việc xử lý hóa đơn đầu vào bị bỏ sót có thể được xác định theo 2 trường hợp sau:

Trường hợp 1: Kê khai bổ sung tại kỳ phát sinh sai, sót

Nếu số thuế GTGT đầu vào bị sai, sót khi kê khai làm tăng số thuế GTGT phải nộp hoặc làm giảm số thuế GTGT được hoàn, người nộp thuế phải thực hiện khai bổ sung tại tháng, quý phát sinh số thuế GTGT đầu vào bị sai, sót.

Khi đó, người nộp thuế phải thực hiện đầy đủ nghĩa vụ thuế phát sinh thêm, bao gồm:

• Nộp bổ sung số thuế phải nộp tăng thêm;
• Trường hợp làm giảm số thuế đã được hoàn thì phải nộp lại số tiền thuế được hoàn tương ứng;
• Nộp tiền chậm nộp vào ngân sách nhà nước nếu phát sinh.

Trường hợp 2: Kê khai tại kỳ phát hiện sai, sót

Nếu số thuế GTGT đầu vào bị sai, sót làm giảm số thuế GTGT phải nộp hoặc chỉ làm tăng, giảm số thuế GTGT còn được khấu trừ chuyển sang kỳ tiếp theo, người nộp thuế thực hiện kê khai tại tháng, quý phát hiện ra sai, sót.

Như vậy, không phải mọi trường hợp hóa đơn đầu vào bỏ sót đều phải quay lại kê khai bổ sung tại kỳ phát sinh hóa đơn. Việc xác định kỳ kê khai cần căn cứ vào ảnh hưởng của khoản thuế GTGT đầu vào bị sai, sót đến nghĩa vụ thuế của doanh nghiệp.

Tóm lại: